AI导哈

生物信息学数据处理工具

为AI代理提供基因搜索、蛋白质结构、临床变异、PubMed文献和DNA序列等生物信息学和生命科学数据处理服务。

  • by AiAgentKarl
  • Python
  • 本地部署
  • 1 星标
  • 更新于
在 GitHub 查看 AiAgentKarl/bioinformatics-mcp-server

使用说明

生物信息学mcp服务器

人工智能代理的生物信息学和生命科学数据 --通过NCBI和UniProt进行基因搜索、蛋白质结构、临床变异、PubMed文献和DNA序列。

不需要API密钥。 10个工具，涵盖6个数据源（NCBI基因、临床变量、分类学、PubMed、序列、UniProt）。

快速开始

pip install bioinformatics-mcp-server

{
  "mcpServers": {
    "bioinformatics": {
      "command": "uvx",
      "args": ["bioinformatics-mcp-server"]
    }
  }
}

你能做什么？

问你的AI代理一些事情，比如：

  • “搜索与癌症相关的基因”
  • “已知BRCA1有哪些临床变异？”
  • “查找PubMed最近关于CRISPR基因编辑的论文”
  • “从UniProt获取人胰岛素的蛋白质结构”
  • “这种生物属于什么物种？”

10工具

NCBI（5种工具）

工具 它做什么
search_genes 按符号、名称或功能搜索基因
get_gene_details NCBI基因ID的完整基因信息
search_clinvar_variants 临床变异和突变
get_taxonomy 生物分类学
get_ncbi_sequence DNA/蛋白质序列（FASTA/GenBank）

UniProt（2个工具）

工具 它做什么
search_proteins 按名称、基因或生物体搜索蛋白质
get_protein_details UniProt登录的蛋白质详细信息

PubMed（3个工具）

工具 它做什么
search_pubmed 搜索生物医学文献
get_pubmed_abstract PubMed文章的完整摘要
get_pubmed_citations 引用特定出版物的文章

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许可证

麻省理工学院

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