图像处理MCP服务器

为ImageJ/Fiji提供的基本MCP服务器,包含Java和Python组件,用于简化与LLM的通信和Fiji功能的封装。

  • by NicoKiaru
  • Java
  • 本地部署
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  • 更新于
在 GitHub 查看 NicoKiaru/fiji_mcp

使用说明

概念验证-ImageJ/Fiji的MCP服务器

看看它在这里看起来如何:https://bsky.app/profile/nkiaru.bsky.social/post/3lrvofh64n225

此仓库包含ImageJ/Fiji的基本MCP服务器。它由两个存储库组成:

  • 斐济工具:(Java)包含一些便于与LLM通信的函数。用于编码的GUI(编辑器)易于用户访问,但机器人无法访问
  • fiji_mcp:(Python)斐济函数的简单包装器,作为MCP服务器的工具公开

要使此服务器与Claude Desktop一起工作,您可以在配置中添加以下内容:

{"mcpServers": 
	{
		"fiji_mcp": {
			"command": "uv",
			"args": [
				"--directory",
				"C:/Users/Nicolas/PycharmProjects/fiji_mcp",
				"run",
				"main.py"
			]
		}
	}
}

fiji工具的罐子必须被构建出来——目前它只能作为SNAPSHOT使用。

	<groupId>ch.epfl.biop</groupId>
	<artifactId>fiji-tools</artifactId>
	<version>0.1.0-SNAPSHOT</version>

请注意,jvm路径必须在Python中硬编码 main.py 代码:

# Entry point to run the server
if __name__ == "__main__":
    import os

    os.environ['JAVA_HOME'] = r'C:\Users\Nicolas\.jdks\corretto-11.0.24'
    os.environ['PATH'] = r'C:\Users\Nicolas\.jdks\corretto-11.0.24\bin;' + os.environ.get('PATH', '')

否则,在执行Claude Desktop的上下文中,找不到jvm。