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临床数据验证服务

CORE MCP Server是一个基于Python FastMCP构建的MCP服务器，用于支持CDISC CORE Rules Engine，提供临床数据集验证、规则浏览和管理功能。

  • by kusy2009
  • Python
  • 本地部署
  • 3 星标
  • 更新于
在 GitHub 查看 kusy2009/core-mcp-server

使用说明

核心MCP服务器

核心MCP服务器 是一个 模型上下文协议 （MCP）服务器 CDISC核心规则引擎.

此MCP服务器由以下组件构建 Python快速MCP.

支持CORE规则引擎

  • 根据CDISC一致性规则验证临床数据集（XPT、JSON、NDJSON、XLSX）
  • 浏览所有981+验证规则，按标准、权限、灵敏度进行过滤
  • 检查单个规则的详细信息（条件、操作、权限参考）
  • 列出支持的标准、版本和受控术语包
  • 从GitHub管理引擎更新

建筑

CORE MCP  ──→  CORE Rules Engine Cache + CLI  (rules, validation)

需求

安装

步骤1：设置CDISC核心规则引擎

如果你还没有CORE规则引擎，克隆它并构建规则缓存：

git clone https://github.com/cdisc-org/cdisc-rules-engine.git
cd cdisc-rules-engine
pip install -r requirements.txt
python core.py update-cache --apikey YOUR_CDISC_LIBRARY_API_KEY

这会将所有验证规则和受控术语下载到本地缓存中。只需要做一次。

步骤2：安装CORE MCP服务器

git clone https://github.com/kusy2009/core-mcp-server.git
cd core-mcp-server
uv sync

将CORE规则引擎的路径设置为环境变量：

export CORE_DIR=/path/to/cdisc-rules-engine

配置MCP客户端

VS代码（GitHub副本）

添加 .vscode/mcp.json 在您的项目中：

{
  "servers": {
    "core-mcp": {
      "command": "uv",
      "args": ["--directory", "/path/to/core-mcp-server", "run", "core-mcp"],
      "env": {
        "CORE_DIR": "/path/to/cdisc-rules-engine"
      }
    }
  }
}

克劳德桌面版

添加到您的Claude Desktop配置中：

{
  "mcpServers": {
    "core-mcp": {
      "command": "uv",
      "args": ["--directory", "/path/to/core-mcp-server", "run", "core-mcp"],
      "env": {
        "CORE_DIR": "/path/to/cdisc-rules-engine"
      }
    }
  }
}

你需要更换 /path/to/core-mcp-server 和 /path/to/cdisc-rules-engine 以适应您自己的环境。

MCP工具

验证

工具 说明
validate_dataset 使用标准、版本、CT和规则过滤器根据CDISC规则验证数据集

规则浏览

工具 说明
list_rules 列出带有可选过滤器（标准、版本、权限、灵敏度、状态）的规则
get_rule_details 获取特定CORE规则ID的完整详细信息
search_rules 按描述或消息中的关键字搜索规则

标准和配置

工具 说明
list_rule_sets 列出所有支持的标准和版本以及规则计数
list_ct_packages 列出可用的受控术语包
get_engine_version 获取CORE版本、git提交信息、缓存统计信息

发动机管理

工具 说明
check_for_updates 检查CORE是否在GitHub上有新的提交
update_engine 从GitHub中提取最新的CORE

许可证

此项目根据MIT许可证获得许可-请参阅 许可证 文件以获取详细信息。

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