Name: DNA序列设计工具
Author: kkomdori

使用说明

exCGen_MCP

使用FastMCP实现exCGen的MCP服务器。从原始网络版本移植：https://github.com/kkomdori/exCGen_v1

exCGen_MCP的特点：

设计互斥的DNA序列：

生成不会相互结合的互斥DNA序列
指定自定义长度（以碱基对为单位）
控制GC含量（鸟嘌呤和胞嘧啶的百分比）
一次创建多个序列对
使用嵌入特定序列的预设图案
避免特定序列（如限制性位点）
确保新序列不会绑定到现有序列

使用案例：

PCR引物的设计
创建分子条形码
开发DNA探针
合成生物学应用

在本地条件下将此MCP连接到Claude Desktop

本指南解释了如何集成 exCGen MCP 服务器和克劳德桌面应用程序。
此项目使用 uv （一个非常快的Python包管理器）自动处理依赖关系和执行。

1.先决条件

在开始之前，请确保已安装以下内容：

Claude桌面应用程序: 点击此处下载.（测试版本：1.0.1768）
Git: 点击此处下载（需要下载代码）。
uv（必填）：此工具管理此项目的Python环境。
- Windows（PowerShell）:
  
  PowerShell
```
powershell -ExecutionPolicy ByPass -c "irm https://astral.sh/uv/install.ps1 | iex"
```
- macOS/Linux:
  
  Bash
```
curl -LsSf https://astral.sh/uv/install.sh | sh
```
注：安装后，重新启动终端并键入 uv --version 以验证其是否正确安装。

2.安装

打开终端（命令提示符或PowerShell），导航到要保存项目的文件夹，然后运行以下命令：

Bash

git clone https://github.com/kkomdori/exCGen_MCP.git
cd exCGen_MCP

（您不需要手动安装依赖项。 uv 连接后将自动处理它们。)

3.查找配置文件

您需要编辑Claude Desktop配置文件，告诉它在哪里可以找到此项目。

打开配置文件位置:
- 视窗：新闻 Win + R，粘贴以下内容，然后按Enter键： %APPDATA%\Claude\
- macOS：打开查找器，按 Cmd + Shift + G，然后输入： ~/Library/Application Support/Claude/
查找名为的文件 claude_desktop_config.json.
- 如果它不存在，请使用该确切名称创建一个新文件。
- 用文本编辑器（记事本、VS Code等）打开它。

4.编辑配置（关键步骤）

将以下代码复制并粘贴到您的 claude_desktop_config.json 文件。 ⚠️ 重要： 您必须替换占位符（例如。， [YOUR_USERNAME])使用您的实际Windows用户名。此配置使用 uv 运行项目，并包含特定的环境变量以防止编码问题（文本显示错误）。

JSON

{
  "mcpServers": {
    "exCGen-MCP": {
      "command": "C:\\Users\\[YOUR_USERNAME]\\.local\\bin\\uv.exe",
      "args": [
        "--directory",
        "C:\\Users\\[YOUR_USERNAME]\\Github\\exCGen_MCP",
        "run",
        "main.py"
      ],
      "env": {
        "PYTHONUTF8": "1",
        "PYTHONIOENCODING": "utf-8"
      }
    }
  }
}

您需要更改的内容：

command：通往你的道路 uv.exe.
- 通常： C:\\Users\\YOUR_NAME\\.local\\bin\\uv.exe
args （项目路径）：下载此项目的路径。
- 核实一下 main.py 存在于您指定的文件夹中。
JSON格式:
- 在Windows上，您必须使用 双睫毛 (\\)对于路径。
- 例子： C:\\Users\\JohnDoe\\...

5.验证连接

重启克劳德桌面应用程序完全。
寻找 插头图标(🔌) 在输入栏的右侧。
点击它并检查 exCGen-MCP 以绿色列出连接状态。