知识图谱导入工具

将Precision Medicine Knowledge Graph (PrimeKG)导入Neo4j数据库以进行数据分析和探索的工具。

  • by dmigo
  • Python
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  • 更新于
在 GitHub 查看 dmigo/primekg-mcp

使用说明

PrimeKG到Neo4j

该项目将精准医学知识图谱(PrimeKG)导入Neo4j数据库进行数据分析和探索。

概述

PrimeKG是一个全面的生物医学知识图谱,整合了20个高质量的生物医学资源,描述了17080种疾病,涉及10个主要生物尺度的400多万个关系。

本项目:

  1. 下载和处理PrimeKG数据
  2. 将数据导入Neo4j图形数据库
  3. 提供查询和分析数据的工具

项目结构

primekg-mcp/
├── config/           # Configuration files
├── data/             # Data files (PrimeKG data will be stored here)
├── docs/             # Documentation
├── scripts/          # Utility scripts for data processing
├── src/              # Source code
│   ├── db/           # Database connection and queries
│   ├── etl/          # Data extraction, transformation, loading
│   └── utils/        # Utility functions
└── tests/            # Test files

安装说明

(安装说明将随着项目的进展而添加)

用法

(使用说明将随着项目的进展而添加)

许可证

(将添加许可证信息)