BV-BRC MCP服务

数据工具

• query_collection：通过灵活的筛选查询任何BV-BRC Solr集合
• solr_collection_parameters：获取集合的架构信息
• solr_query_instructions：获取查询语法帮助
• solr_collections：列出所有可用收藏

维修工具

• list_service_apps：列出所有可用的BV-BRC分析服务
• get_job_details：查询已提交作业的状态
• 提交作业以进行各种分析：
  • 基因组组装
  • 基因组注释
  • 全面基因组分析
  • 爆破
  • 引物
  • 变异分析
  • TnSeq
  • 系统发育树（细菌基因组树、基因树）
  • SNP分析（全基因组，MSA）
  • 宏基因组学（分类、Binning、Read Mapping）
  • 测序
  • 病毒服务（严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型分析、序列提交）
  • 还有更多。..

工作区工具

• workspace_browse_tool：统一的浏览/搜索工具（递归搜索或检查路径作为文件夹列表/文件元数据）
• get_file_metadata：获取工作区文件或本地会话文件的规范化元数据
• workspace_download_file_tool：下载工作区文件
• workspace_upload：将文件上载到工作区
• create_genome_group：创建基因组组
• create_feature_group：创建要素组
• get_genome_group_ids：从组中获取基因组ID
• get_feature_group_ids：从组中获取功能ID

步骤1：启用开发人员模式

1. 点击 加 在“问我任何问题”旁边
2. 点击 “添加源”
3. 现在，您应该在聊天框下方看到“来源”和“添加”
4. 点击 下箭头 “添加”旁边
5. 点击 “连接更多”
6. 向下滚动至 高级设置
7. 单击旁边的切换 开发者模式 （必须为“on”）
8. 点击 < 返回

步骤2：创建MCP服务器连接

1. 在右上角，单击 “创建”
2. 填写以下内容：
   • 图标：可选
   • 名字：BV-BRC MCP
   • 描述: ''
   • MCP服务器URL: https://dev-7.bv-brc.org/mcp
3. 认证:
   • 在OAuth上保留身份验证
4. 如果您有以下情况，请勾选此框 信任此应用程序
5. 点击 “创建”

步骤3：连接到您的服务器

1. 您现在应该在下面看到“BV-BRC MCP” “已启用应用程序和连接器”
2. 单击左上角的“X”返回聊天屏幕
3. 在一个 新聊天，单击“+”按钮并将鼠标悬停在 更多

• 你应该看看 BV-BRC MCP 作为以下选项 画布

4. 选择 BV-BRC MCP

1. 点击 账户 在左下角，然后转到 设置
2. 点击 '连接器'
3. 点击 '添加自定义连接器'
4. 填写以下内容：
   • 名字：BV-BRC MCP
   • 远程MCP服务器URL: https://dev-7.bv-brc.org/mcp
5. 点击 '添加'
6. 然后单击 '连接'
7. 登录BV-BRC
8. 现在可以在新聊天中使用它

打开终端

0. 克隆Github仓库
   复制

   git clone https://github.com/cucinellclark/bvbrc-mcp-server
   cd bvbrc-mcp-server