FHIR数据查询服务器

CData的FHIR MCP服务器为LLMs提供本地只读的FHIR数据查询服务,通过自然语言问题获取实时信息,无需SQL。

  • by CDataSoftware
  • Java
  • 本地部署
  • 更新于
在 GitHub 查看 CDataSoftware/fhir-mcp-server-by-cdata

使用说明

fhir-mcp-server-by-cdata 翻译为中文是:“由CData提供的FHIR MCP服务器”

CData的FHIR模型上下文协议(MCP)服务器

⚠️ 此项目构建了一个本地、只读的MCP服务器。如需完全远程访问MCP,请查看首个托管的MCP平台: CData Connect AI对于本地托管、具备完整的读、写、更新、删除及操作功能,并且设置简便的解决方案,请查看我们的 CData FHIR MCP服务器。

目的

我们创建了这个只读的MCP服务器,以便允许大型语言模型(如Claude Desktop)查询由FHIR支持的实时数据 CData JDBC 驱动程序 for FHIR。

CData JDBC驱动程序通过将FHIR作为关系型SQL模型暴露出来,实现与FHIR的连接。

这个服务器封装了该驱动程序,并通过一个简单的MCP接口提供FHIR数据,因此大型语言模型(LLMs)可以通过自然语言提问来检索实时信息——无需使用SQL。

设置指南

  1. 克隆仓库:
    git clone https://github.com/cdatasoftware/fhir-mcp-server-by-cdata.git
    cd fhir-mcp-server-by-cdata
    
  2. 构建服务器:
    mvn clean install
    
    这会生成一个JAR文件:CDataMCP-jar-with-dependencies.jar
  3. 下载并安装适用于{source}的CData JDBC驱动程序: https://www.cdata.com/drivers/fhir/download/jdbc 的中文翻译为:“https://www.cdata.com/驱动程序/FHIR/下载/JDBC”
  4. 许可CData JDBC驱动程序:
    • 导航至 lib 安装目录中的文件夹,通常为:
      • (Windows) C:\Program Files\CData\CData JDBC Driver for FHIR\
      • (Mac/Linux) /Applications/CData JDBC Driver for FHIR/
    • 运行该命令 java -jar cdata.jdbc.fhir.jar --license
    • 请输入您的姓名、电子邮件和“TRIAL”(或您的许可证密钥)。
  5. 配置您与数据源的连接(以Salesforce为例):
    • 运行该命令 java -jar cdata.jdbc.fhir.jar 打开连接字符串实用程序。

    • 配置连接字符串并点击“测试连接”

      注: 如果数据源使用OAuth,您需要在浏览器中进行身份验证。

    • 一旦成功,复制连接字符串以便后续使用。

  6. 创建一个 .prp 为您的JDBC连接准备文件(例如。 fhir.prp) 使用以下属性和格式:
    • 前缀 - 用于暴露的工具的前缀
    • 服务器名称 - 您服务器的名称
    • 服务器版本 - 适用于您服务器的版本
    • 驱动程序路径 - 您的JDBC驱动程序JAR文件的完整路径
    • 驱动程序类 - JDBC驱动程序类的名称(例如:cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver)
    • JdbcUrl(JDBC URL) - 使用CData JDBC驱动程序连接到您的数据时所需的JDBC连接字符串(从上面复制)
    • 桌子 - 留空以访问所有数据,否则您可以明确声明您希望创建访问权限的表
      Prefix=fhir
      ServerName=CDataFHIR
      ServerVersion=1.0
      DriverPath=PATH\TO\cdata.jdbc.fhir.jar
      DriverClass=cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver
      JdbcUrl=jdbc:fhir:InitiateOAuth=GETANDREFRESH;
      Tables=
      

使用Claude Desktop连接服务器

  1. 创建用于Claude桌面的配置文件(claude_desktop_config.json),以添加新的MCP服务器,使用以下格式。如果文件已存在,请将条目添加到文件中 mcpServers 在配置文件中。

    Windows

    {
      "mcpServers": {
        "{classname_dash}": {
          "command": "PATH\\TO\\java.exe",
          "args": [
            "-jar",
            "PATH\\TO\\CDataMCP-jar-with-dependencies.jar",
            "PATH\\TO\\fhir.prp"
          ]
        },
        ...
      }
    }
    

    Linux/Mac(注:此处“/”表示“或”的意思,即Linux系统或Mac系统)

    {
      "mcpServers": {
        "{classname_dash}": {
          "command": "/PATH/TO/java",
          "args": [
            "-jar",
            "/PATH/TO/CDataMCP-jar-with-dependencies.jar",
            "/PATH/TO/fhir.prp"
          ]
        },
        ...
      }
    }
    

    如有需要,请将配置文件复制到相应的目录(以Claude Desktop为例)。 Windows

    cp C:\PATH\TO\claude_desktop_config.json %APPDATA%\Claude\claude_desktop_config.json
    

    Linux/麦金塔(Mac)

    cp /PATH/TO/claude_desktop_config.json /Users/{user}/Library/Application\ Support/Claude/claude_desktop_config.json'
    
  2. 运行或刷新您的客户端(Claude 桌面版)。

注: 您可能需要完全退出或关闭您的Claude桌面客户端,然后重新打开它,以便MCP服务器显示出来。

运行服务器

  1. 运行以下命令以单独启动MCP服务器
    java -jar /PATH/TO/CDataMCP-jar-with-dependencies.jar /PATH/TO/Salesforce.prp
    

注: 服务器使用 stdio 因此,只能与运行在与服务器同一台机器上的客户端一起使用。

使用详情

一旦配置好MCP服务器,AI客户端将能够使用内置工具来读取、写入、更新和删除底层数据。通常情况下,您无需显式调用这些工具。只需让客户端回答有关底层数据系统的问题即可。例如:

  • “我的已成交机会与客户所属行业之间存在怎样的关联?”
  • “我在SUPPORT项目中有多少张未解决的工单?”
  • “你能告诉我我今天有哪些日程安排吗?”

以下列出了可用的工具及其描述:

工具与说明

在以下定义中, {servername} 指的是配置文件中MCP服务器的名称(例如。 {classname_dash} (如上所述)。

  • {servername}_get_tables - 获取数据源中可用的表列表。使用 {servername}_get_columns 工具用于列出表中可用的列。该工具的输出将以CSV格式返回,第一行包含列标题。
  • {servername}_get_columns - 获取表的列列表。使用 {servername}_get_tables 工具用于获取可用表的列表。该工具的输出将以CSV格式返回,第一行包含列标题。
  • {servername}_run_query - 执行SQL SELECT查询

JSON-RPC 请求示例

如果你正在为发送到MCP服务器的请求编写脚本,而不是使用AI客户端(例如Claude),那么在调用可用工具时,你可以参考以下遵循JSON-RPC 2.0规范的JSON有效载荷示例。

获取数据源表

{
    "jsonrpc": "2.0",
    "id": 1,
    "method": "tools/call",
    "params": {
        "name": "source_get_tables",
        "arguments": {}
    }
}

获取源列

{
    "jsonrpc": "2.0",
    "id": 2,
    "method": "tools/call",
    "params": {
        "name": "source_get_columns",
        "arguments": {
            "table":  "Account"
        }
    }
}

源运行查询

{
    "jsonrpc": "2.0",
    "id": 3,
    "method": "tools/call",
    "params": {
        "name": "source_run_query",
        "arguments": {
            "sql":  "SELECT * FROM [Account] WHERE [IsDeleted] = true"
        }
    }
}

故障排除

  1. 如果你在Claude Desktop中看不到你的CData MCP服务器,请确保你已经完全退出了Claude Desktop(Windows系统:使用任务管理器;Mac系统:使用活动监视器)
  2. 如果Claude Desktop无法检索数据,请确保您已正确配置连接。使用连接字符串构建器创建连接字符串(见上文),然后将连接字符串复制到属性(.prp)文件中。
  3. 如果您在连接到数据源时遇到问题,请联系 CData 支持团队。
  4. 如果您在使用MCP服务器时遇到问题,或有任何其他反馈,请加入 CData 社区。

许可证

这个MCP服务器是根据MIT许可证授权的。这意味着您可以在遵守MIT许可证条款和条件的前提下,自由地使用、修改和分发该软件。如需更多详情,请参阅 许可证 项目仓库中的文件。

所有支持的来源

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